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    我目前是北京师范大学珠海校区复杂系统国际科学中心的一名在读博士生,

    硕士和本科分别就读于中国矿业大学和四川农业大学物理专业。

    主要关注:

    • 多肽药物
    • AI for protein
    • 蛋白质语言(PLM)

    指导教师

  • 发表作品

    文章

    1) Shu Li#, Lu Peng#, Liuqing Chen#, Linjie Que, Wenqingqing Kang, Xiaojun Hu, Zengru Di, Yu Liu*. Discovering highly bioactive peptides via ladderpath theory-based hierarchical reconstructor and molecular dynamics simulations. Journal of Chemical Information and Modeling 64: 8164-8175 (2024).

    2) Lu Peng, Zecheng Zhang, Xianyi Wang, Weiyi Qiu, Liqian Zhou, Hui Xiao, Chunxiuzi Liu, Shaohua Tang, Zhiwei Qin, Jiakun Jiang, Zengru Di, Yu Liu*. Theoretical perspective on synthetic man-made life: Learning from the origin of life. Quantitative Biology 11: 376-394 (2023).

    3) Zecheng Zhang, Chunxiuzi Liu, Yingjun Zhu, Lu Peng, Weiyi Qiu, Qianyuan Tang, He Liu, Ke Zhang, Zengru Di, Yu Liu*. Evolutionary Tinkering Enriches the Hierarchical and Interlaced Structures in Amino Acid Sequences. Physical Review Research 6: 023215 (2024).

    4) Lu Peng, Jun Tang*, Jun Ma, Jingmin Luo. The influence of Autapse on Synchronous firing in Small-World Neural Networks. Physica A 594: 126956 (2022).
    5) Lu Peng, Jun Tang*. Unpinning the spiral waves by using parameter waves. Chinese Physics B 30: 058202 (2021).
    6) Xudong Wang, Lu Peng, Jun Tang*. Understanding noise-controlled 2D bistable switch by approximating 1D potential. Nonlinear Dynamics 104: 1405-1414 (2021).

    注:#代表共同第一作者,*代表通讯作者

    会议

    1) 2024.10 中国物理学会2024秋季学术会议(口头报告)

    2) 2024.07 第18届Q-Bio国际定量生物学会议(海报宣讲)

    3) 2023.12 北京师范大学2023交叉学科论坛暨非线性科学理论应用前沿研讨会(志愿服务)

    4) 2023.08 参与并通过昆明理工大学2023 年“复杂物理系统的挑战与新机遇”暑期研讨班

    5) 2023.07 第七届全国统计物理与复杂系统会议(海报宣讲)

    6) 2023.05 第七届中国系统科学大会(口头报告)

    7) 2023.05 第六届江苏物理春季学术会议(口头报告)

    8) 2022.11 十八届全国复杂网络学术会议(志愿服务)
    9) 2021.12 第六届北京软物质科学与工程论坛会议(口头报告)
    10) 2021.10 中国物理学会2020/2021秋季会议(海报宣讲)

    科普

    1) 集智俱乐部 | 通过层次结构信息和分子动力学模拟发现高活性肽 (前沿进展)

    2) 集智俱乐部 | 合成人造生命的理论视角:从生命起源中学习 (长文综述)

    3) QB期刊 | 合成人造生命的理论视角:从生命起源中学习 (短文介绍)

    项目、专利

    1) 2020 - 2022,CUMT中央高校基本科研业务费专项资金项目“电磁场背景下的神经胶质网络系统的建模研究” (参与)

    2) 刘宇, 李舒, 彭璐, 陈柳青. "多肽生成方法及装置". CN117612637A, 2024-02-27. (发明专利)

    3) 汪建, 罗梦菲, 彭璐, 田梦慧. "一种红外牛羊畜牧测量计数装置". CN208240073U, 2018-12-14. (实用新型专利)

  • 主要关注点

    多肽药物,AI for protein,蛋白质语言

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    多肽药物

    使用梯径方法解构多肽,再通过PepHiRe重构多肽,生成“相似但不同”的新多肽。

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    AI for protein

    蛋白质的结构决定功能,是否可以对每个domain进行功能阐述,从而定向设计蛋白?

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    蛋白质语言

    蛋白质或许也是一种语言,是否可以找到一种token的方式,让神经网络更好的了解这门语言